1.1.3 Typning/sekvensering (HPV)

Detta är ett exempel på laboratoriesvar för typning av humant papillomvirus (HPV) med genetiska analyser (DNA) på cervixsekret. Typning svaras först ut ordinalt (positiv/negativ). De identifierade typerna svaras sen ut nominalt i en kommentar.

1. Visning av provsvar för typning/sekvensering av HPV i nationell patientöversikt (NPÖ)

SAKNAR VERIFIERAD NPU-KOD visas om NPU-koden inte finns i det urval som Equalis förvaltar för NPÖ och 1177 journal.

2. Tabell med kodade värden som använts i exemplet ovan och tillhörande kommentarer

#	Namn	Kod	Benämning	Kodverk	Urval	Kommentar
Prov
1.	material	258451005	cervixsekret	Snomed CT	urval provtyp laboratoriemedicin	Provmaterial kan även anges som fritext.
Laboratorieanalys
	status	398166005	utförd	Snomed CT	urval analysstatus laboratoriemedicin
2.	kod	NPU14485	Cx—HPV-DNA	NPU	urval analyskoder laboratoriemedicin	För analyser som svaras ut ordinalt så väljs koder med egenskapsslaget “arbiträr koncentration”. För analyser som svaras ut “nominalt” så väljs koder med egenskapsslaget “taxon” eller “kategori”.
Laboratorieanalysresultat
	typ	NPU14485	Cx—HPV-DNA	NPU	urval analyskoder laboratoriemedicin
3.	värde	10828004	positiv	Snomed CT	urval fynd övrigt laboratoriemedicin	Resultaten kan koderas med en Snomed CT kod eller fritext.
4.	kommentar		Typ 35, 40, 51, 52, 53, 59, 68			Kommentaren anges med fritext.

3. Informationsmodell för typning/sekvensering (HPV)

4. XML-kod för exemplet typning/sekvensering (HPV)

			<laboratoryOrderOutcome>
				<header xmlns='urn:riv:clinicalprocess:healthcond:actoutcome:4'>
					<accessControlHeader>
						<accountableCareGiver>
							<root>1.2.752.129.2.1.4.1</root>
							<extension>TSTNMT2321000156-1002</extension>
						</accountableCareGiver>
						<accountableCareUnit>
							<root>1.2.752.129.2.1.4.1</root>
							<extension>TSTNMT2321000156-1003</extension>
						</accountableCareUnit>
						<lockTime>20180107105400</lockTime>
						<blockComparisonTime>20180107105400</blockComparisonTime>
						<approvedForPatient>true</approvedForPatient>
					</accessControlHeader>
					<sourceSystemId>
						<root>1.2.752.129.2.1.4.1</root>
						<extension>LOAD-MOCKS</extension>
					</sourceSystemId>
					<record>
						<id>
							<root>LOAD-MOCKS</root>
							<extension>LOAD-MOCKS-GMH-DEMO-24</extension>
						</id>
						<timestamp>20180107105400</timestamp>
					</record>
					<author>
						<id>
							<root>1.2.752.129.2.1.4.1</root>
							<extension>TESTNMT00123-OJFG</extension>
						</id>
						<name>PC Jersild</name>
						<timestamp>20180107105400</timestamp>
						<byRole>
							<originalText>Läkare</originalText>
						</byRole>
					</author>
					<signature>
						<id>
							<root>1.2.752.129.2.1.4.1</root>
							<extension>SE162321000024-0004</extension>
						</id>
						<name>Marie Carlsson</name>
						<timestamp>20180108105400</timestamp>
						<byRole>
							<originalText>Läkare</originalText>
						</byRole>
					</signature>
				</header>
				<body xmlns='urn:riv:clinicalprocess:healthcond:actoutcome:4'>
					<identifier>
						<root>LOAD-MOCKS</root>
						<extension>LOAD-MOCKS-GMH-DEMO-24</extension>
					</identifier>
					<laboratoryIdentifier>
						<root>LAB-IDENTIFIER</root>
						<extension>LAB-IDENTIFIER-24</extension>
					</laboratoryIdentifier>
					<type>
						<code>final</code>
						<codeSystem>2.16.840.1.113883.4.642.3.235</codeSystem>
						<displayName>Slutsvar</displayName>
					</type>
					<referral>
						<identifier>
							<root>LOAD-MOCKS</root>
							<extension>RID-24</extension>
						</identifier>
						<timestamp>20180107105400</timestamp>
						<version>1</version>
						<question>HPV?</question>
						<requester>
							<id>
								<root>1.2.752.129.2.1.4.1</root>
								<extension>TESTNMT00123-OJFG</extension>
							</id>
							<name>Maria Gustafsson</name>
							<byRole>
								<originalText>Läkare</originalText>
							</byRole>
							<orgUnit>
								<id>
									<root>1.2.752.129.2.1.4.1</root>
									<extension>TSTNMT2321000156-1003</extension>
								</id>
								<name>Infektionsavdelning, Uppsala</name>
							</orgUnit>
						</requester>
					</referral>
					<groupOfAnalyses>
						<analysis>
							<identifier>
								<root>LOAD-MOCKS</root>
								<extension>LOAD-MOCKS-GMH-DEMO-24</extension>
							</identifier>
							<timestamp>20180107175400</timestamp>
							<code>
								<code>NPU14485</code>
								<codeSystem>1.2.752.108.1</codeSystem>
								<codeSystemName>NPU</codeSystemName>
								<displayName>Cx—HPV-DNA</displayName>
							</code>
							<status>
								<code>398166005</code>
								<codeSystem>1.2.752.116.2.1.1</codeSystem>
								<codeSystemName>Snomed CT</codeSystemName>
								<displayName>utförd</displayName>
							</status>
							<accredited>false</accredited>
							<specimen>
								<material>
									<code>258451005</code>
									<codeSystem>1.2.752.116.2.1.1</codeSystem>
									<displayName>cervixsekret</displayName>
								</material>
								<timestamp>20180107105400</timestamp>
							</specimen>
							<result>
								<type>
									<code>NPU14485</code>
									<codeSystem>1.2.752.108.1</codeSystem>
									<codeSystemName>NPU</codeSystemName>
									<displayName>Cx—HPV-DNA</displayName>
								</type>
								<value>
									<cv>
										<code>10828004</code>
										<codeSystem>1.2.752.116.2.1.1</codeSystem>
										<codeSystemName>Snomed CT</codeSystemName>
										<displayName>positiv</displayName>
									</cv>
								</value>
								<comment>Typ 35,40,51,52,53,59,68</comment>
							</result>
						</analysis>
					</groupOfAnalyses>
					<recipientUnit>
						<name>Infektionsavdelning, Uppsala</name>
					</recipientUnit>
					<contactInformation>
						<text>Laboratoriemedicin Uppsala 018-123 456 789</text>
					</contactInformation>