1.3.1 Sårodling med resistensbestämning- 2 fynd (SIR & MIC)

Detta är ett exempel på ett provsvar från ett sår på höger fot. Odlingen resulterar i två fynd, Staphylococcus aureus (Fynd 1) och E. coli (Fynd 2). En resistensbestämning görs med 8 olika antibiotika. Resultaten svaras ut som SIR eller med MIC-värden och tillhörande tolkning. Laboratoriet har valt att kalla denna analysgrupp för “Sår/sekret odling 1”.

1. Visning av provsvar för sårodling med resistensbestämning i nationell patientöversikt (NPÖ)

image-20241107-115354.png
Siffrorna indikerar var informationen i tabellen nedan visas i gränssnittet.

SAKNAR VERIFIERAD NPU-KOD visas om NPU-koden inte finns i det urval som Equalis förvaltar för NPÖ och 1177 journal.

2. Tabell med kodade värden som används i exemplet ovan och tillhörande kommentarer

#

Namn

Kod

Benämning

Kodverk

Urval

Kommentar

#

Namn

Kod

Benämning

Kodverk

Urval

Kommentar

Analysgrupp

1.

namn

 

SÅR/SEKRET ODLING 1

 

 

Laboratoriet har valt att namnge analysgruppen med fritext.

Prov

2.

material

122566000

sårsekret

Snomed CT

urval provtyp laboratoriemedicin

Provmaterial kan även anges som fritext.

3.

lokalisation

7769000

höger fot

Snomed CT

urval anatomisk lokalisation laboratoriemedicin

Lokalisation kan även anges som fritext.

Laboratorieanalys (odling)

 

status

398166005

utförd

Snomed CT

urval analysstatus laboratoriemedicin

 

4.

kod

NPU12304

Sårv—Bakterieodling

NPU

urval analyskoder laboratoriemedicin

För odlingsanalyser som svaras ut med fynd av bakterier så väljs NPU-koder med egenskapsslaget “taxon”.

Laboratorieanalys (resistensbestämning)

5.

kod

NPU59212

Betalaktamasresistenta pc

NPU

urval analyskoder laboratoriemedicin

Separata NPU-koder används för respektive antibiotika. Notera att olika koder också används för resultat som svaras ut som SIR eller MIC-värden (mg/L).

NPU06015

Cefotaxim

NPU06021

Cefuroxim

NPU54378

Ciprofloxacin (MIC)

NPU06030

Fusidinsyra

NPU06046

Gentamicin

NPU06034

Klindamycin

NPU07436

Sulfametoxazol+Trimetoprim

Laboratorieanalysresultat (odling)

 

typ

NPU12304

Sårv—Bakterieodling

NPU

urval analyskoder laboratoriemedicin

 

6.

värde

 

Växt av Staphylococcus aureus

 

 

I detta fall skickas svaret med fritext. Fyndet Staphylococcus aureus kan också koderas med en Snomed CT kod 3092008 | Staphylococcus aureus | från urval fynd mikroorganism laboratoriemedicin

Växt av E. Coli

 

 

I detta fall skickas svaret med fritext. Fyndet E. Coli kan också koderas med en Snomed CT kod 112283007 | Escherichia coli | från urval fynd mikroorganism laboratoriemedicin

Laboratorieanalysresultat (resistensbestämning)

 

typ

NPU59212

Betalaktamasresistenta pc

NPU

urval analyskoder laboratoriemedicin

 

NPU06015

Cefotaxim

NPU06021

Cefuroxim

NPU54378

Ciprofloxacin (MIC)

NPU06030

Fusidinsyra

NPU06046

Gentamicin

NPU06034

Klindamycin

NPU07436

Sulfametoxazol+Trimetoprim

7.

värde

131196009

S

Snomed CT

urval fynd resistens laboratoriemedicin

Ordinala resultat koderas med en Snomed CT kod.

8.

tolkning

131196009

S

Snomed CT

 

131196009 = S

3. Informationsmodell för sårodling med resistensbestämning

 

image-20241107-114733.png
Informationsmodell för sårodling med resistensbestämning

4. XML-kod för exemplet sårodling med resistensbestämning

<s:Envelope xmlns:s="http://schemas.xmlsoap.org/soap/envelope/"> <s:Body xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xmlns:xsd="http://www.w3.org/2001/XMLSchema"> <GetLaboratoryOrderOutcomeResponse xmlns="urn:riv:clinicalprocess:healthcond:actoutcome:GetLaboratoryOrderOutcomeResponder:4"> <laboratoryOrderOutcome> <header xmlns="urn:riv:clinicalprocess:healthcond:actoutcome:4"> <accessControlHeader> <accountableCareGiver> <root>1.2.752.129.2.1.4.1</root> <extension>TSTNMT2321000156-1002</extension> </accountableCareGiver> <accountableCareUnit> <root>1.2.752.129.2.1.4.1</root> <extension>TSTNMT2321000156-1003</extension> </accountableCareUnit> <blockComparisonTime>20190710110200</blockComparisonTime> <approvedForPatient>true</approvedForPatient> </accessControlHeader> <sourceSystemId> <root>1.2.752.129.2.1.4.1</root> <extension>HSATEST2-D2V</extension> </sourceSystemId> <record> <id> <root>198943b6-5e75-48ae-9f5c-af9bc240da50</root> <extension>LOAD-MOCKS-GMH-DEMO-6</extension> </id> <timestamp>20190710110200</timestamp> </record> </header> <body xmlns="urn:riv:clinicalprocess:healthcond:actoutcome:4"> <identifier> <root>407adb21-7ffc-498e-9dcf-e9ffafa688bb</root> <extension>LOAD-MOCKS-GMH-DEMO-6</extension> </identifier> <type> <code>final</code> <codeSystem>2.16.840.1.113883.4.642.3.235</codeSystem> <displayName>Slutsvar</displayName> </type> <referral> <identifier> <root>3b74cd4b-3e7d-426a-9dba-ee43837ec43e</root> <extension>LOAD-MOCKS-GMH-DEMO-6</extension> </identifier> <timestamp>20190710110200</timestamp> <requester> <id> <root>1.2.752.129.2.1.4.1</root> <extension>TESTNMT00123-OJFG</extension> </id> <name>Emma Olsson</name> <byRole> <originalText>Läkare</originalText> </byRole> <orgUnit> <id> <root>1.2.752.129.2.1.4.1</root> <extension>SE2321000198-019221</extension> </id> <name>Ortopedisk avdelning, Kalmar</name> </orgUnit> </requester> </referral> <groupOfAnalyses> <name>SÅR/SEKRET ODLING 1</name> <analysis> <identifier> <root>bc23f517-a32b-45c9-8910-12669bce6a6a</root> <extension>LOAD-MOCKS-GMH-DEMO-6</extension> </identifier> <code> <code>NPU12304</code> <codeSystem>1.2.752.108.1</codeSystem> <codeSystemName>NPU</codeSystemName> <displayName>Sårv—Bakterieodling</displayName> </code> <status> <code>398166005</code> <codeSystem>1.2.752.116.2.1.1</codeSystem> <displayName>utförd</displayName> </status> <accredited>true</accredited> <specimen> <material> <code>122566000</code> <codeSystem>1.2.752.116.2.1.1</codeSystem> <displayName>sårsekret</displayName> </material> <timestamp>20190710110200</timestamp> <anatomicalLocation> <code>7769000</code> <codeSystem>1.2.752.116.2.1.1</codeSystem> <codeSystemName>Snomed CT</codeSystemName> <displayName>höger fot</displayName> </anatomicalLocation> </specimen> <result> <type> <code>NPU12304</code> <codeSystem>1.2.752.108.1</codeSystem> <codeSystemName>NPU</codeSystemName> <displayName>Sårv—Bakterieodling</displayName> </type> <value> <st>Växt av Staphylococcus aureus</st> </value> <related> <code> <code>NPU59212</code> <codeSystem>1.2.752.108.1</codeSystem> <codeSystemName>NPU</codeSystemName> <displayName>Betalaktamresistenta pc</displayName> </code> <result> <type> <code>NPU59212</code> <codeSystem>1.2.752.108.1</codeSystem> <codeSystemName>NPU</codeSystemName> <displayName>Betalaktamresistenta pc</displayName> </type> <value> <cv> <code>131196009</code> <codeSystem>1.2.752.116.2.1.1</codeSystem> <displayName>S</displayName> </cv> </value> </result> </related> <related> <code> <code>NPU06030</code> <codeSystem>1.2.752.108.1</codeSystem> <codeSystemName>NPU</codeSystemName> <displayName>Fusidinsyra</displayName> </code> <result> <type> <code>NPU06030</code> <codeSystem>1.2.752.108.1</codeSystem> <codeSystemName>NPU</codeSystemName> <displayName>Fusidinsyra</displayName> </type> <value> <cv> <code>131196009</code> <codeSystem>1.2.752.116.2.1.1</codeSystem> <displayName>S</displayName> </cv> </value> </result> </related> <related> <code> <code>NPU06046</code> <codeSystem>1.2.752.108.1</codeSystem> <codeSystemName>NPU</codeSystemName> <displayName>Gentamicin</displayName> </code> <result> <type> <code>NPU06046</code> <codeSystem>1.2.752.108.1</codeSystem> <codeSystemName>NPU</codeSystemName> <displayName>Gentamicin</displayName> </type> <value> <cv> <code>131196009</code> <codeSystem>1.2.752.116.2.1.1</codeSystem> <displayName>S</displayName> </cv> </value> </result> </related> <related> <code> <code>NPU06034</code> <codeSystem>1.2.752.108.1</codeSystem> <codeSystemName>NPU</codeSystemName> <displayName>Klindamycin</displayName> </code> <result> <type> <code>NPU06034</code> <codeSystem>1.2.752.108.1</codeSystem> <codeSystemName>NPU</codeSystemName> <displayName>Klindamycin</displayName> </type> <value> <cv> <code>131196009</code> <codeSystem>1.2.752.116.2.1.1</codeSystem> <displayName>S</displayName> </cv> </value> </result> </related> </result> <result> <type> <code>NPU12304</code> <codeSystem>1.2.752.108.1</codeSystem> <codeSystemName>NPU</codeSystemName> <displayName>Sårv—Bakterieodling</displayName> </type> <value> <st>Växt av E.coli</st> </value> <related> <code> <code>NPU06015</code> <codeSystem>1.2.752.108.1</codeSystem> <codeSystemName>NPU</codeSystemName> <displayName>Cefotaxim</displayName> </code> <result> <type> <code>NPU06015</code> <codeSystem>1.2.752.108.1</codeSystem> <codeSystemName>NPU</codeSystemName> <displayName>Cefotaxim</displayName> </type> <value> <cv> <code>131196009</code> <codeSystem>1.2.752.116.2.1.1</codeSystem> <displayName>S</displayName> </cv> </value> </result> </related> <related> <code> <code>NPU06021</code> <codeSystem>1.2.752.108.1</codeSystem> <codeSystemName>NPU</codeSystemName> <displayName>Cefuroxim</displayName> </code> <result> <type> <code>NPU06021</code> <codeSystem>1.2.752.108.1</codeSystem> <codeSystemName>NPU</codeSystemName> <displayName>Cefuroxim</displayName> </type> <value> <cv> <code>131196009</code> <codeSystem>1.2.752.116.2.1.1</codeSystem> <displayName>S</displayName> </cv> </value> </result> </related> <related> <code> <code>NPU54378</code> <codeSystem>1.2.752.108.1</codeSystem> <codeSystemName>NPU</codeSystemName> <displayName>Ciprofloxacin</displayName> </code> <result> <type> <code>NPU54378</code> <codeSystem>1.2.752.108.1</codeSystem> <codeSystemName>NPU</codeSystemName> <displayName>Ciprofloxacin</displayName> </type> <value> <pq> <value>0,24</value> <unit>mg/L</unit> </pq> </value> <comment>kommentar till känslighet</comment> <interpretation> <code>131196009</code> <codeSystem>1.2.752.116.2.1.1</codeSystem> <displayName>S</displayName> </interpretation> </result> </related> <related> <code> <code>NPU06046</code> <codeSystem>1.2.752.108.1</codeSystem> <codeSystemName>NPU</codeSystemName> <displayName>Gentamicin</displayName> </code> <result> <type> <code>NPU06046</code> <codeSystem>1.2.752.108.1</codeSystem> <codeSystemName>NPU</codeSystemName> <displayName>Gentamicin</displayName> </type> <value> <cv> <code>131196009</code> <codeSystem>1.2.752.116.2.1.1</codeSystem> <displayName>S</displayName> </cv> </value> </result> </related> <related> <code> <code>NPU07436</code> <codeSystem>1.2.752.108.1</codeSystem> <codeSystemName>NPU</codeSystemName> <displayName>Sulfametoxazol+Trimetoprim</displayName> </code> <result> <type> <code>NPU07436</code> <codeSystem>1.2.752.108.1</codeSystem> <codeSystemName>NPU</codeSystemName> <displayName>Sulfametoxazol+Trimetoprim</displayName> </type> <value> <cv> <code>131196009</code> <codeSystem>1.2.752.116.2.1.1</codeSystem> <displayName>S</displayName> </cv> </value> </result> </related> </result> </analysis> </groupOfAnalyses> <recipientUnit> <id> <root>1.2.752.129.2.1.4.1</root> <extension>SE2321000198-019221</extension> </id> <name>Ortopedisk avdelning, Kalmar</name> </recipientUnit> <contactInformation> <text>Laboratoriemedicin Kalmar 0480-123 456 789</text> </contactInformation> </body> </laboratoryOrderOutcome> </GetLaboratoryOrderOutcomeResponse> </s:Body> </s:Envelope>