1.3.2 Sårodling med resistensbestämning (SIR & MIC)
- Rebecca Ceder
Detta är ett exempel på ett provsvar från ett sår på vänster knä. Odling resulterar i ett fynd (Staphylococcus aureus). En resistensbestämning utförs med ett flertal olika antibiotika/substanser. I detta exempel används både diskdiffusion och MIC-bestämning. För MIC-bestämningen görs i vissa fall en tolkning (S, I eller R), vilken läggs i tolkningsfältet. Exemplet visar också hur en kommentar kan läggas till ett resultat i resistenstabellen (Tobramycin i exemplet).
1. Visning av provsvar för sårodling med resistensbestämning i nationell patientöversikt (NPÖ)
2. Tabell med kodade värden som används i exemplet ovan och tillhörande kommentarer
# | Namn | Kod | Benämning | Kodverk | Urval | Kommentar |
|---|---|---|---|---|---|---|
Analysgrupp | ||||||
1. | namn |
| SÅRODLING |
|
| Laboratoriet har valt att namnge analysgruppen med fritext. |
Prov | ||||||
2. | material | 122566000 | sårsekret | Snomed CT | Provmaterialet kan även anges som fritext. | |
3. | lokalisation |
| vänster knä |
|
| Lokalisationen är angiven som fritext. Går även att ange en Snomed-CT kod från urval anatomisk lokalisation laboratoriemedicin |
Laboratorieanalys (odling) | ||||||
| status | 398166005 | utförd | Snomed CT |
| |
4. | kod | Sårv—Bakterieodling | NPU | För odlingsanalyser som svaras ut med fynd av bakterier så väljs NPU-koder med egenskapsslaget “taxon”. | ||
Laboratorieanalys (resistensbestämning) | ||||||
5. | kod | Ciprofloxacin | NPU | Separata NPU-koder används för respektive antibiotika. Notera att olika koder också används för resultat som svaras ut som SIR eller MIC-värden (mg/L). | ||
Meropenem | ||||||
Meropenem (MIC) | ||||||
Piperacillin+Tazobaktam | ||||||
Piperacillin+Tazobaktam (MIC) | ||||||
Tobramycin (MIC) | ||||||
6. | metod | 703725008 | odling | Snomed CT | Det är frivilligt att ange metod. | |
Laboratorieanalysresultat (odling) | ||||||
| typ | Sårv—Bakterieodling | NPU |
| ||
7. | värde | 3092008 | Staphylococcus aureus | Snomed CT | Svaret kan också anges i fritext. | |
Laboratorieanalysresultat (resistensbestämning) | ||||||
| typ | Ciprofloxacin | NPU |
| ||
Meropenem | ||||||
Meropenem (MIC) | ||||||
Piperacillin+Tazobaktam | ||||||
Piperacillin+Tazobaktam (MIC) | ||||||
Tobramycin (MIC) | ||||||
8. | värde | 131196009 | S | Snomed CT | Ordinala resultat koderas med en Snomed CT kod. | |
264841006 | I | |||||
30714006 | R | |||||
9. | tolkning | 131196009 | S | Snomed CT |
| 131196009 = S |
10. | kommentar |
|
|
|
| En kommentar kan ges för resultatet till respektive substans. |
3. Informationsmodell för sårodling med resistensbestämning
4. XML-kod för sårodling med resistensbestämning
<s:Envelope xmlns:s="http://schemas.xmlsoap.org/soap/envelope/">
<s:Body xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xmlns:xsd="http://www.w3.org/2001/XMLSchema">
<GetLaboratoryOrderOutcomeResponse xmlns="urn:riv:clinicalprocess:healthcond:actoutcome:GetLaboratoryOrderOutcomeResponder:4">
<laboratoryOrderOutcome>
<header xmlns="urn:riv:clinicalprocess:healthcond:actoutcome:4">
<accessControlHeader>
<accountableCareGiver>
<root>1.2.752.129.2.1.4.1</root>
<extension>TSTNMT2321000156-1002</extension>
</accountableCareGiver>
<accountableCareUnit>
<root>1.2.752.129.2.1.4.1</root>
<extension>TSTNMT2321000156-1003</extension>
</accountableCareUnit>
<blockComparisonTime>20220104081500</blockComparisonTime>
<approvedForPatient>true</approvedForPatient>
</accessControlHeader>
<sourceSystemId>
<root>1.2.752.129.2.1.4.1</root>
<extension>HSATEST2-D2V</extension>
</sourceSystemId>
<record>
<id>
<root>LOAD-MOCKS</root>
<extension>LOAD-MOCKS-GMH-DEMO-8</extension>
</id>
<timestamp>20220104081500</timestamp>
</record>
</header>
<body xmlns="urn:riv:clinicalprocess:healthcond:actoutcome:4">
<identifier>
<root>LOAD-MOCKS</root>
<extension>LOAD-MOCKS-GMH-DEMO-8</extension>
</identifier>
<type>
<code>final</code>
<codeSystem>2.16.840.1.113883.4.642.3.235</codeSystem>
<displayName>Slutsvar</displayName>
</type>
<referral>
<identifier>
<root>LOAD-MOCKS</root>
<extension>LOAD-MOCKS-GMH-DEMO-8</extension>
</identifier>
<timestamp>20220104081500</timestamp>
<requester>
<id>
<root>1.2.752.129.2.1.4.1</root>
<extension>TESTNMT00123-OJFG</extension>
</id>
<name>Johan Nilsson</name>
<byRole>
<originalText>Läkare</originalText>
</byRole>
<orgUnit>
<id>
<root>1.2.752.129.2.1.4.1</root>
<extension>SE2321000198-019221</extension>
</id>
<name>Infektionsavdelning, Östergötland</name>
</orgUnit>
</requester>
</referral>
<groupOfAnalyses>
<name>Sårodling</name>
<analysis>
<identifier>
<root>LOAD-MOCKS</root>
<extension>LOAD-MOCKS-GMH-DEMO-8</extension>
</identifier>
<code>
<code>NPU12304</code>
<codeSystem>1.2.752.108.1</codeSystem>
<codeSystemName>NPU</codeSystemName>
<displayName>Sårv—Bakterieodling</displayName>
</code>
<method>
<code>703725008</code>
<codeSystem>1.2.752.116.2.1.1</codeSystem>
<codeSystemName>Snomed CT</codeSystemName>
<displayName>odling</displayName>
</method>
<status>
<code>398166005</code>
<codeSystem>1.2.752.116.2.1.1</codeSystem>
<displayName>utförd</displayName>
</status>
<accredited>true</accredited>
<specimen>
<material>
<code>122566000</code>
<codeSystem>1.2.752.116.2.1.1</codeSystem>
<displayName>sårsekret</displayName>
</material>
<timestamp>20220104081500</timestamp>
<anatomicalLocation>
<originalText>vänster knä</originalText>
</anatomicalLocation>
</specimen>
<result>
<type>
<code>NPU12304</code>
<codeSystem>1.2.752.108.1</codeSystem>
<codeSystemName>NPU</codeSystemName>
<displayName>Sårv—Bakterieodling</displayName>
</type>
<value>
<cv>
<code>3092008</code>
<codeSystem>1.2.752.116.2.1.1</codeSystem>
<codeSystemName>Snomed CT</codeSystemName>
<displayName>Staphylococcus aureus</displayName>
</cv>
</value>
<related>
<code>
<code>NPU06049</code>
<codeSystem>1.2.752.108.1</codeSystem>
<codeSystemName>NPU</codeSystemName>
<displayName>Ciprofloxacin</displayName>
</code>
<result>
<type>
<code>NPU06049</code>
<codeSystem>1.2.752.108.1</codeSystem>
<codeSystemName>NPU</codeSystemName>
<displayName>Ciprofloxacin</displayName>
</type>
<value>
<cv>
<code>264841006</code>
<codeSystem>1.2.752.116.2.1.1</codeSystem>
<displayName>I</displayName>
</cv>
</value>
</result>
</related>
<related>
<code>
<code>NPU06037</code>
<codeSystem>1.2.752.108.1</codeSystem>
<codeSystemName>NPU</codeSystemName>
<displayName>Meropenem</displayName>
</code>
<result>
<type>
<code>NPU06037</code>
<codeSystem>1.2.752.108.1</codeSystem>
<codeSystemName>NPU</codeSystemName>
<displayName>Meropenem</displayName>
</type>
<value>
<cv>
<code>30714006</code>
<codeSystem>1.2.752.116.2.1.1</codeSystem>
<displayName>R</displayName>
</cv>
</value>
</result>
</related>
<related>
<code>
<code>NPU54390</code>
<codeSystem>1.2.752.108.1</codeSystem>
<codeSystemName>NPU</codeSystemName>
<displayName>Meropenem (MIC)</displayName>
</code>
<result>
<type>
<code>NPU54390</code>
<codeSystem>1.2.752.108.1</codeSystem>
<codeSystemName>NPU</codeSystemName>
<displayName>Meropenem (MIC)</displayName>
</type>
<value>
<pq>
<value>1</value>
<unit>mg/L</unit>
</pq>
</value>
</result>
</related>
<related>
<code>
<code>NPU07424</code>
<codeSystem>1.2.752.108.1</codeSystem>
<codeSystemName>NPU</codeSystemName>
<displayName>Piperacillin+Tazobaktam</displayName>
</code>
<result>
<type>
<code>NPU07424</code>
<codeSystem>1.2.752.108.1</codeSystem>
<codeSystemName>NPU</codeSystemName>
<displayName>Piperacillin+Tazobaktam</displayName>
</type>
<value>
<cv>
<code>264841006</code>
<codeSystem>1.2.752.116.2.1.1</codeSystem>
<displayName>I</displayName>
</cv>
</value>
</result>
</related>
<related>
<code>
<code>NPU54397</code>
<codeSystem>1.2.752.108.1</codeSystem>
<codeSystemName>NPU</codeSystemName>
<displayName>Piperacillin+Tazobakta (MIC)</displayName>
</code>
<result>
<type>
<code>NPU54397</code>
<codeSystem>1.2.752.108.1</codeSystem>
<codeSystemName>NPU</codeSystemName>
<displayName>Piperacillin+Tazobakta (MIC)</displayName>
</type>
<value>
<pq>
<value>10</value>
<unit>mg/L</unit>
</pq>
</value>
<interpretation>
<code>264841006</code>
<codeSystem>1.2.752.116.2.1.1</codeSystem>
<displayName>I</displayName>
</interpretation>
</result>
</related>
<related>
<code>
<code>NPU54402</code>
<codeSystem>1.2.752.108.1</codeSystem>
<codeSystemName>NPU</codeSystemName>
<displayName>Tobramycin (MIC)</displayName>
</code>
<result>
<type>
<code>NPU54402</code>
<codeSystem>1.2.752.108.1</codeSystem>
<codeSystemName>NPU</codeSystemName>
<displayName>Tobramycin (MIC)</displayName>
</type>
<value>
<pq>
<value>1,5</value>
<unit>mg/L</unit>
</pq>
</value>
<comment>Ges ofta med andra antibiotika</comment>
<interpretation>
<code>131196009</code>
<codeSystem>1.2.752.116.2.1.1</codeSystem>
<displayName>S</displayName>
</interpretation>
</result>
</related>
</result>
</analysis>
</groupOfAnalyses>
<recipientUnit>
<id>
<root>1.2.752.129.2.1.4.1</root>
<extension>SE2321000198-019221</extension>
</id>
<name>Infektionsavdelning, Östergötland</name>
</recipientUnit>
<contactInformation>
<text>Laboratoriemedicin Östergötland 026-155555</text>
</contactInformation>
</body>
</laboratoryOrderOutcome>
</GetLaboratoryOrderOutcomeResponse>
</s:Body>
</s:Envelope>