1.3.8 VRE-screening, odling och resistensbestämning (SIR & MIC)
- Rebecca Ceder
Owned by Rebecca Ceder
Detta är ett exempel på ett laboratoriesvar för screening av VRE (vanA och vanB DNA) i ett fecesprov. Det positiva provet resulterar i en odling för verifiering av resultaten, och påföljande resistensbestämning med ett flertal antibiotika, vilka svaras ut ordinalt (SIR) och kvantitativt (MIC-värden).
1. Visning av provsvar för VRE-screening, odling och resistensbestämning i nationell patientöversikt (NPÖ)
Siffrorna indikerar var informationen i tabellen nedan visas i gränssnittet.
SAKNAR VERIFIERAD NPU-KOD visas om NPU-koden inte finns i det urval som Equalis förvaltar för NPÖ och 1177 journal.
2. Tabell med kodade värden som används i exemplet ovan och tillhörande kommentarer
# | Namn | Kod | Benämning | Kodverk | Urval | Kommentar |
|---|---|---|---|---|---|---|
Analysgrupp | ||||||
1. | namn |
| VRE |
|
| Laboratoriet har valt att namnge analysgruppen med fritext. |
2. | gruppkommentar |
| Obs! VRE vancomycinresistent enterokock. VRE är anmälningspliktig enligt smittskyddslagen. |
|
|
|
Prov | ||||||
3. | material | 119339001 | feces | Snomed CT | Provmaterialet kan även anges som fritext. | |
Laboratorieanalys (screening och odling) | ||||||
| status | 398166005 | utförd | Snomed CT |
| |
4. | kod | F—VRE screen, vanA | NPU | För screening-analyser som svaras ut ordinalt så väljs NPU-koder med egenskapsslaget “arbiträr koncentration” | ||
F—VRE screen, vanB | ||||||
F—VRE odling | För odlingsanalyser som svaras ut med fynd av bakterier så väljs NPU-koder med egenskapsslaget “taxon”. | |||||
5. | metod | 258066000 | PCR | Snomed CT | Det är frivilligt att ange metod. | |
703725008 | odling | |||||
Laboratorieanalys (resistensbestämning) | ||||||
6. | kod | Teikoplanin | NPU | Separata NPU-koder används för respektive antibiotika. Notera att olika koder också används för resultat som svaras ut som SIR eller MIC-värden (mg/L). | ||
Teikoplanin (MIC) | ||||||
Vankomycin | ||||||
Vankomycin (MIC) | ||||||
Laboratorieanalysresultat (screening och odling) | ||||||
| typ | F—VRE screen, vanA | NPU |
| ||
F—VRE screen, vanB | ||||||
F—VRE odling | ||||||
7. | värde | 10828004 | positiv | Snomed CT | Resultaten kan koderas med en Snomed CT kod eller fritext. | |
260385009 | negativ | |||||
8. | 90272000 | Enterococcus faecium | ||||
Laboratorieanalysresultat (resistensbestämning) | ||||||
| typ | Teikoplanin | NPU |
| ||
Teikoplanin (MIC) | ||||||
Vankomycin | ||||||
Vankomycin (MIC) | ||||||
9. | värde | 30714006 | R | Snomed CT | Ordinala resultat koderas med en Snomed CT kod. | |
3. Informationsmodell för en VRE-screening, odling och resistensbestämning
Informationsmodell för en VRE-screening, odling och tillhörande resistensbestämning
4. XML-kod för exemplet VRE-screening, odling och resistensbestämning
<s:Envelope xmlns:s="http://schemas.xmlsoap.org/soap/envelope/">
<s:Body xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xmlns:xsd="http://www.w3.org/2001/XMLSchema">
<GetLaboratoryOrderOutcomeResponse xmlns="urn:riv:clinicalprocess:healthcond:actoutcome:GetLaboratoryOrderOutcomeResponder:4">
<laboratoryOrderOutcome>
<header xmlns="urn:riv:clinicalprocess:healthcond:actoutcome:4">
<accessControlHeader>
<accountableCareGiver>
<root>1.2.752.129.2.1.4.1</root>
<extension>TSTNMT2321000156-1002</extension>
</accountableCareGiver>
<accountableCareUnit>
<root>1.2.752.129.2.1.4.1</root>
<extension>TSTNMT2321000156-1003</extension>
</accountableCareUnit>
<blockComparisonTime>20181228120300</blockComparisonTime>
<approvedForPatient>true</approvedForPatient>
</accessControlHeader>
<sourceSystemId>
<root>1.2.752.129.2.1.4.1</root>
<extension>HSATEST2-D2V</extension>
</sourceSystemId>
<record>
<id>
<root>LOAD-MOCKS</root>
<extension>LOAD-MOCKS-GMH-DEMO-14</extension>
</id>
<timestamp>20181228120300</timestamp>
</record>
</header>
<body xmlns="urn:riv:clinicalprocess:healthcond:actoutcome:4">
<identifier>
<root>LOAD-MOCKS</root>
<extension>LOAD-MOCKS-GMH-DEMO-14</extension>
</identifier>
<type>
<code>final</code>
<codeSystem>2.16.840.1.113883.4.642.3.235</codeSystem>
<displayName>Slutsvar</displayName>
</type>
<referral>
<identifier>
<root>LOAD-MOCKS</root>
<extension>LOAD-MOCKS-GMH-DEMO-14</extension>
</identifier>
<timestamp>20181228120300</timestamp>
<requester>
<id>
<root>1.2.752.129.2.1.4.1</root>
<extension>TESTNMT00123-OJFG</extension>
</id>
<name>Sofia Svensson</name>
<byRole>
<originalText>Läkare</originalText>
</byRole>
<orgUnit>
<id>
<root>1.2.752.129.2.1.4.1</root>
<extension>SE2321000198-019221</extension>
</id>
<name>Hjärtavdelning, Blekinge</name>
</orgUnit>
</requester>
</referral>
<groupOfAnalyses>
<name>VRE</name>
<comment>OBS! VRE vancomycinresistent enterokock. VRE är anmälningspliktig enligt smittskyddslagen.</comment>
<analysis>
<identifier>
<root>LOAD-MOCKS</root>
<extension>LOAD-MOCKS-GMH-DEMO-14</extension>
</identifier>
<code>
<code>SWE05716</code>
<codeSystem>1.2.752.108.1</codeSystem>
<codeSystemName>NPU</codeSystemName>
<displayName>F—VRE screen, vanA</displayName>
</code>
<method>
<code>258066000</code>
<codeSystem>1.2.752.116.2.1.1</codeSystem>
<codeSystemName>Snomed CT</codeSystemName>
<displayName>PCR</displayName>
</method>
<status>
<code>398166005</code>
<codeSystem>1.2.752.116.2.1.1</codeSystem>
<displayName>utförd</displayName>
</status>
<accredited>true</accredited>
<specimen>
<material>
<code>119339001</code>
<codeSystem>1.2.752.116.2.1.1</codeSystem>
<displayName>feces</displayName>
</material>
<timestamp>20181228120300</timestamp>
</specimen>
<result>
<type>
<code>SWE05716</code>
<codeSystem>1.2.752.108.1</codeSystem>
<codeSystemName>NPU</codeSystemName>
<displayName>F—VRE screen, vanA</displayName>
</type>
<value>
<cv>
<code>10828004</code>
<codeSystem>1.2.752.116.2.1.1</codeSystem>
<codeSystemName>Snomed CT</codeSystemName>
<displayName>positiv</displayName>
</cv>
</value>
</result>
</analysis>
<analysis>
<identifier>
<root>LOAD-MOCKS</root>
<extension>LOAD-MOCKS-GMH-DEMO-14</extension>
</identifier>
<code>
<code>SWE05717</code>
<codeSystem>1.2.752.108.1</codeSystem>
<codeSystemName>NPU</codeSystemName>
<displayName>F—VRE screen, vanB</displayName>
</code>
<method>
<code>258066000</code>
<codeSystem>1.2.752.116.2.1.1</codeSystem>
<codeSystemName>Snomed CT</codeSystemName>
<displayName>PCR</displayName>
</method>
<status>
<code>398166005</code>
<codeSystem>1.2.752.116.2.1.1</codeSystem>
<displayName>utförd</displayName>
</status>
<accredited>true</accredited>
<specimen>
<material>
<code>119339001</code>
<codeSystem>1.2.752.116.2.1.1</codeSystem>
<displayName>feces</displayName>
</material>
<timestamp>20181228120300</timestamp>
</specimen>
<result>
<type>
<code>SWE05717</code>
<codeSystem>1.2.752.108.1</codeSystem>
<codeSystemName>NPU</codeSystemName>
<displayName>F—VRE screen, vanB</displayName>
</type>
<value>
<cv>
<code>260385009</code>
<codeSystem>1.2.752.116.2.1.1</codeSystem>
<codeSystemName>Snomed CT</codeSystemName>
<displayName>negativ</displayName>
</cv>
</value>
</result>
</analysis>
<analysis>
<identifier>
<root>LOAD-MOCKS</root>
<extension>LOAD-MOCKS-GMH-DEMO-14</extension>
</identifier>
<code>
<code>NPU58734</code>
<codeSystem>1.2.752.108.1</codeSystem>
<codeSystemName>NPU</codeSystemName>
<displayName>F—VRE odling</displayName>
</code>
<method>
<code>703725008</code>
<codeSystem>1.2.752.116.2.1.1</codeSystem>
<codeSystemName>Snomed CT</codeSystemName>
<displayName>odling</displayName>
</method>
<status>
<code>398166005</code>
<codeSystem>1.2.752.116.2.1.1</codeSystem>
<displayName>utförd</displayName>
</status>
<accredited>true</accredited>
<specimen>
<material>
<code>119339001</code>
<codeSystem>1.2.752.116.2.1.1</codeSystem>
<displayName>feces</displayName>
</material>
<timestamp>20181228120300</timestamp>
</specimen>
<result>
<type>
<code>NPU58734</code>
<codeSystem>1.2.752.108.1</codeSystem>
<codeSystemName>NPU</codeSystemName>
<displayName>F—VRE odling</displayName>
</type>
<value>
<cv>
<code>90272000</code>
<codeSystem>1.2.752.116.2.1.1</codeSystem>
<codeSystemName>Snomed CT</codeSystemName>
<displayName>Enterococcus faecium</displayName>
</cv>
</value>
<related>
<code>
<code>NPU07433</code>
<codeSystem>1.2.752.108.1</codeSystem>
<codeSystemName>NPU</codeSystemName>
<displayName>Teikoplanin</displayName>
</code>
<result>
<type>
<code>NPU07433</code>
<codeSystem>1.2.752.108.1</codeSystem>
<codeSystemName>NPU</codeSystemName>
<displayName>Teikoplanin</displayName>
</type>
<value>
<cv>
<code>30714006</code>
<codeSystem>1.2.752.116.2.1.1</codeSystem>
<displayName>R</displayName>
</cv>
</value>
</result>
</related>
<related>
<code>
<code>NPU29668</code>
<codeSystem>1.2.752.108.1</codeSystem>
<codeSystemName>NPU</codeSystemName>
<displayName>Teikoplanin (MIC)</displayName>
</code>
<result>
<type>
<code>NPU29668</code>
<codeSystem>1.2.752.108.1</codeSystem>
<codeSystemName>NPU</codeSystemName>
<displayName>Teikoplanin (MIC)</displayName>
</type>
<value>
<intervalPQ>
<low>256</low>
<lowClosed>false</lowClosed>
<unit>mg/L</unit>
</intervalPQ>
</value>
</result>
</related>
<related>
<code>
<code>NPU07437</code>
<codeSystem>1.2.752.108.1</codeSystem>
<codeSystemName>NPU</codeSystemName>
<displayName>Vankomycin</displayName>
</code>
<result>
<type>
<code>NPU07437</code>
<codeSystem>1.2.752.108.1</codeSystem>
<codeSystemName>NPU</codeSystemName>
<displayName>Vankomycin</displayName>
</type>
<value>
<cv>
<code>30714006</code>
<codeSystem>1.2.752.116.2.1.1</codeSystem>
<displayName>R</displayName>
</cv>
</value>
</result>
</related>
<related>
<code>
<code>NPU53162</code>
<codeSystem>1.2.752.108.1</codeSystem>
<codeSystemName>NPU</codeSystemName>
<displayName>Vankomycin (MIC)</displayName>
</code>
<result>
<type>
<code>NPU53162</code>
<codeSystem>1.2.752.108.1</codeSystem>
<codeSystemName>NPU</codeSystemName>
<displayName>Vankomycin (MIC)</displayName>
</type>
<value>
<intervalPQ>
<low>256</low>
<lowClosed>false</lowClosed>
<unit>mg/L</unit>
</intervalPQ>
</value>
</result>
</related>
</result>
</analysis>
</groupOfAnalyses>
<recipientUnit>
<id>
<root>1.2.752.129.2.1.4.1</root>
<extension>SE2321000198-019221</extension>
</id>
<name>Hjärtavdelning, Blekinge</name>
</recipientUnit>
<contactInformation>
<text>Laboratoriemedicin Blekinge 0455-123 456 789</text>
</contactInformation>
</body>
</laboratoryOrderOutcome>
</GetLaboratoryOrderOutcomeResponse>
</s:Body>
</s:Envelope>