1.3.3 Urinodling: kvantitativ och resistensbestämning (SIR)
- Rebecca Ceder
Owned by Rebecca Ceder
Detta är ett exempel på ett provsvar från en urinodling (från mittstråleprov) med två fynd (Enterococcus faecalis samt Escherichia coli). En antalskoncentrationbestämning görs av respektive bakteriefynd samt efterföljande resistensbestämning med ett flertal antibiotika/substanser. Dessa resultat svaras ut ordinalt (SIR). Antalskoncentrationsbestämningen svaras i vissa fall ut som en kommentar till fyndet.
1. Visning av provsvar för urinodling med kvantifiering och resistensbestämning i nationell patientöversikt (NPÖ)
Siffrorna indikerar var informationen i tabellen nedan visas i gränssnittet.
2. Tabell med kodade värden som används i exemplet ovan och tillhörande kommentarer
# | Namn | Kod | Benämning | Kodverk | Urval | Kommentar |
|---|---|---|---|---|---|---|
Analysgrupp | ||||||
1. | namn |
| URINODLING |
|
| Laboratoriet har valt att namnge analysgruppen med fritext. |
Prov | ||||||
2. | material | 258574006 | urin, mittstråle | Snomed CT | Provmaterialet kan även anges som fritext. | |
Laboratorieanalys (odling) | ||||||
| status | 398166005 | utförd | Snomed CT |
| |
3. | kod | U(mittstr)—Bakterieodling | NPU | För odlingsanalyser som svaras ut med fynd av bakterier så väljs NPU-koder med egenskapsslaget “taxon”. | ||
4. | metod | 703725008 | odling | Snomed CT | Det är frivilligt att ange metod. | |
Laboratorieanalys (kvantifiering) | ||||||
5. | kod | U(mittstr)—Bakterie (ant) | NPU | För kvantifiering av antal bakterier så kan NPU-koder användas med egenskapsslaget “arbiträr antalskoncentration”
När separata NPU-koder inte kan anges för kvantifieringen så kan resultatet av kvantifieringen läggas i kommentaren till odlingsanalysen för respektive fynd (som i exemplet). | ||
Laboratorieanalys (resistensbestämning) | ||||||
6. | kod | Amoxicillin | NPU | Separata NPU-koder används för respektive antibiotika. Notera att olika koder också används för resultat som svaras ut som SIR eller MIC-värden (mg/L). | ||
Amoxicillin+Klavulansyra | ||||||
Ciprofloxacin | ||||||
Mecillinam | ||||||
Nitrofurantoin | ||||||
Piperacillin+Tazobaktam | ||||||
Trimetoprim | ||||||
Laboratorieanalysresultat (odling) | ||||||
| typ | U(mittstr)—Bakterieodling | NPU |
| ||
7. | värde | 78065002 | Enterococcus faecalis | Snomed CT | Svaret kan också anges i fritext. | |
112283007 | Escherichia coli | |||||
Laboratorieanalysresultat (kvantifiering) | ||||||
| typ | U(mittstr)—Bakterie (ant) | NPU |
| ||
Laboratorieanalysresultat (resistensbestämning) | ||||||
| typ | Amoxicillin | NPU |
| ||
Amoxicillin+Klavulansyra | ||||||
Ciprofloxacin | ||||||
Mecillinam | ||||||
Nitrofurantoin | ||||||
Piperacillin+Tazobaktam | ||||||
Trimetoprim | ||||||
8. | värde | 131196009 | S | Snomed CT | Ordinala resultat koderas med en Snomed CT kod. | |
264841006 | I | |||||
30714006 | R | |||||
3. Informationsmodell för en kvantitativ urinodling med resistensbestämning
Informationsmodell för kvantitativ urinodling med tillhörande resistensbestämning
4. XML-kod för exemplet kvantitativ urinodling med resistensbestämning
<s:Envelope xmlns:s="http://schemas.xmlsoap.org/soap/envelope/">
<s:Body xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xmlns:xsd="http://www.w3.org/2001/XMLSchema">
<GetLaboratoryOrderOutcomeResponse xmlns="urn:riv:clinicalprocess:healthcond:actoutcome:GetLaboratoryOrderOutcomeResponder:4">
<laboratoryOrderOutcome>
<header xmlns="urn:riv:clinicalprocess:healthcond:actoutcome:4">
<accessControlHeader>
<accountableCareGiver>
<root>1.2.752.129.2.1.4.1</root>
<extension>TSTNMT2321000156-1002</extension>
</accountableCareGiver>
<accountableCareUnit>
<root>1.2.752.129.2.1.4.1</root>
<extension>TSTNMT2321000156-1003</extension>
</accountableCareUnit>
<blockComparisonTime>20180102143000</blockComparisonTime>
<approvedForPatient>true</approvedForPatient>
</accessControlHeader>
<sourceSystemId>
<root>1.2.752.129.2.1.4.1</root>
<extension>HSATEST2-D2V</extension>
</sourceSystemId>
<record>
<id>
<root>LOAD-MOCKS</root>
<extension>LOAD-MOCKS-GMH-DEMO-9</extension>
</id>
<timestamp>20180102143000</timestamp>
</record>
</header>
<body xmlns="urn:riv:clinicalprocess:healthcond:actoutcome:4">
<identifier>
<root>LOAD-MOCKS</root>
<extension>LOAD-MOCKS-GMH-DEMO-9</extension>
</identifier>
<type>
<code>final</code>
<codeSystem>2.16.840.1.113883.4.642.3.235</codeSystem>
<displayName>Slutsvar</displayName>
</type>
<referral>
<identifier>
<root>LOAD-MOCKS</root>
<extension>LOAD-MOCKS-GMH-DEMO-9</extension>
</identifier>
<timestamp>20180102143000</timestamp>
<requester>
<id>
<root>1.2.752.129.2.1.4.1</root>
<extension>TESTNMT00123-OJFG</extension>
</id>
<name>Johan Olsson</name>
<byRole>
<originalText>Läkare</originalText>
</byRole>
<orgUnit>
<id>
<root>1.2.752.129.2.1.4.1</root>
<extension>SE2321000198-019221</extension>
</id>
<name>Akutmottagning, Stockholm</name>
</orgUnit>
</requester>
</referral>
<groupOfAnalyses>
<name>Urinodling</name>
<analysis>
<identifier>
<root>LOAD-MOCKS</root>
<extension>LOAD-MOCKS-GMH-DEMO-9</extension>
</identifier>
<code>
<code>NPU06096</code>
<codeSystem>1.2.752.108.1</codeSystem>
<codeSystemName>NPU</codeSystemName>
<displayName>U(mittstr)—Bakterieodling</displayName>
</code>
<method>
<code>703725008</code>
<codeSystem>1.2.752.116.2.1.1</codeSystem>
<codeSystemName>Snomed CT</codeSystemName>
<displayName>odling</displayName>
</method>
<status>
<code>398166005</code>
<codeSystem>1.2.752.116.2.1.1</codeSystem>
<displayName>utförd</displayName>
</status>
<accredited>true</accredited>
<specimen>
<material>
<code>258574006</code>
<codeSystem>1.2.752.116.2.1.1</codeSystem>
<displayName>urin, mittstråle</displayName>
</material>
<timestamp>20180102143000</timestamp>
</specimen>
<result>
<type>
<code>NPU06096</code>
<codeSystem>1.2.752.108.1</codeSystem>
<codeSystemName>NPU</codeSystemName>
<displayName>U(mittstr)—Bakterieodling</displayName>
</type>
<value>
<cv>
<code>78065002</code>
<codeSystem>1.2.752.116.2.1.1</codeSystem>
<codeSystemName>Snomed CT</codeSystemName>
<displayName>Enterococcus faecalis</displayName>
</cv>
</value>
<comment>100 000 CFU/mL</comment>
<related>
<code>
<code>NPU06001</code>
<codeSystem>1.2.752.108.1</codeSystem>
<codeSystemName>NPU</codeSystemName>
<displayName>Amoxicillin</displayName>
</code>
<result>
<type>
<code>NPU06001</code>
<codeSystem>1.2.752.108.1</codeSystem>
<codeSystemName>NPU</codeSystemName>
<displayName>Amoxicillin</displayName>
</type>
<value>
<cv>
<code>131196009</code>
<codeSystem>1.2.752.116.2.1.1</codeSystem>
<displayName>S</displayName>
</cv>
</value>
</result>
</related>
<related>
<code>
<code>NPU07424</code>
<codeSystem>1.2.752.108.1</codeSystem>
<codeSystemName>NPU</codeSystemName>
<displayName>Piperacillin+Tazobaktam</displayName>
</code>
<result>
<type>
<code>NPU07424</code>
<codeSystem>1.2.752.108.1</codeSystem>
<codeSystemName>NPU</codeSystemName>
<displayName>Piperacillin+Tazobaktam</displayName>
</type>
<value>
<cv>
<code>131196009</code>
<codeSystem>1.2.752.116.2.1.1</codeSystem>
<displayName>S</displayName>
</cv>
</value>
</result>
</related>
<related>
<code>
<code>NPU06049</code>
<codeSystem>1.2.752.108.1</codeSystem>
<codeSystemName>NPU</codeSystemName>
<displayName>Ciprofloxacin</displayName>
</code>
<result>
<type>
<code>NPU06049</code>
<codeSystem>1.2.752.108.1</codeSystem>
<codeSystemName>NPU</codeSystemName>
<displayName>Ciprofloxacin</displayName>
</type>
<value>
<cv>
<code>30714006</code>
<codeSystem>1.2.752.116.2.1.1</codeSystem>
<displayName>R</displayName>
</cv>
</value>
</result>
</related>
<related>
<code>
<code>NPU06047</code>
<codeSystem>1.2.752.108.1</codeSystem>
<codeSystemName>NPU</codeSystemName>
<displayName>Trimetoprim</displayName>
</code>
<result>
<type>
<code>NPU06047</code>
<codeSystem>1.2.752.108.1</codeSystem>
<codeSystemName>NPU</codeSystemName>
<displayName>Trimetoprim</displayName>
</type>
<value>
<cv>
<code>264841006</code>
<codeSystem>1.2.752.116.2.1.1</codeSystem>
<displayName>I</displayName>
</cv>
</value>
</result>
</related>
</result>
<result>
<type>
<code>NPU06096</code>
<codeSystem>1.2.752.108.1</codeSystem>
<codeSystemName>NPU</codeSystemName>
<displayName>U(mittstr)—Bakterieodling</displayName>
</type>
<value>
<cv>
<code>112283007</code>
<codeSystem>1.2.752.116.2.1.1</codeSystem>
<codeSystemName>Snomed CT</codeSystemName>
<displayName>Escherichia coli</displayName>
</cv>
</value>
<comment>100 000 CFU/mL</comment>
<related>
<code>
<code>NPU06002</code>
<codeSystem>1.2.752.108.1</codeSystem>
<codeSystemName>NPU</codeSystemName>
<displayName>Amoxicillin+Klavulansyra</displayName>
</code>
<result>
<type>
<code>NPU06002</code>
<codeSystem>1.2.752.108.1</codeSystem>
<codeSystemName>NPU</codeSystemName>
<displayName>Amoxicillin+Klavulansyra</displayName>
</type>
<value>
<cv>
<code>131196009</code>
<codeSystem>1.2.752.116.2.1.1</codeSystem>
<displayName>S</displayName>
</cv>
</value>
</result>
</related>
<related>
<code>
<code>NPU06044</code>
<codeSystem>1.2.752.108.1</codeSystem>
<codeSystemName>NPU</codeSystemName>
<displayName>Mecillinam</displayName>
</code>
<result>
<type>
<code>NPU06044</code>
<codeSystem>1.2.752.108.1</codeSystem>
<codeSystemName>NPU</codeSystemName>
<displayName>Mecillinam</displayName>
</type>
<value>
<cv>
<code>131196009</code>
<codeSystem>1.2.752.116.2.1.1</codeSystem>
<displayName>S</displayName>
</cv>
</value>
</result>
</related>
<related>
<code>
<code>NPU06048</code>
<codeSystem>1.2.752.108.1</codeSystem>
<codeSystemName>NPU</codeSystemName>
<displayName>Nitrofurantoin</displayName>
</code>
<result>
<type>
<code>NPU06048</code>
<codeSystem>1.2.752.108.1</codeSystem>
<codeSystemName>NPU</codeSystemName>
<displayName>Nitrofurantoin</displayName>
</type>
<value>
<cv>
<code>131196009</code>
<codeSystem>1.2.752.116.2.1.1</codeSystem>
<displayName>S</displayName>
</cv>
</value>
</result>
</related>
<related>
<code>
<code>NPU06047</code>
<codeSystem>1.2.752.108.1</codeSystem>
<codeSystemName>NPU</codeSystemName>
<displayName>Trimetoprim</displayName>
</code>
<result>
<type>
<code>NPU06047</code>
<codeSystem>1.2.752.108.1</codeSystem>
<codeSystemName>NPU</codeSystemName>
<displayName>Trimetoprim</displayName>
</type>
<value>
<cv>
<code>131196009</code>
<codeSystem>1.2.752.116.2.1.1</codeSystem>
<displayName>S</displayName>
</cv>
</value>
</result>
</related>
</result>
</analysis>
</groupOfAnalyses>
<recipientUnit>
<id>
<root>1.2.752.129.2.1.4.1</root>
<extension>SE2321000198-019221</extension>
</id>
<name>Akutmottagning, Stockholm</name>
</recipientUnit>
<contactInformation>
<text>Laboratoriemedicin Stockholm 08-123 456 789</text>
</contactInformation>
</body>
</laboratoryOrderOutcome>
</GetLaboratoryOrderOutcomeResponse>
</s:Body>
</s:Envelope>