1.1.3 Typning/sekvensering (HPV)
- Rebecca Ceder
Owned by Rebecca Ceder
Detta är ett exempel på laboratoriesvar för typning av humant papillomvirus (HPV) med genetiska analyser (DNA) på cervixsekret. Typning svaras först ut ordinalt (positiv/negativ). De identifierade typerna svaras sen ut nominalt i en kommentar.
1. Visning av provsvar för typning/sekvensering av HPV i nationell patientöversikt (NPÖ)
Siffrorna indikerar var informationen i tabellen nedan visas i gränssnittet.
SAKNAR VERIFIERAD NPU-KOD visas om NPU-koden inte finns i det urval som Equalis förvaltar för NPÖ och 1177 journal.
2. Tabell med kodade värden som använts i exemplet ovan och tillhörande kommentarer
# | Namn | Kod | Benämning | Kodverk | Urval | Kommentar |
|---|---|---|---|---|---|---|
Prov |
|
|
|
|
|
|
1. | material | 258451005 | cervixsekret | Snomed CT | Provmaterial kan även anges som fritext. | |
Laboratorieanalys | ||||||
| status | 398166005 | utförd | Snomed CT |
| |
2. | kod | Cx—HPV-DNA | NPU | För analyser som svaras ut ordinalt så väljs koder med egenskapsslaget “arbiträr koncentration”. För analyser som svaras ut “nominalt” så väljs koder med egenskapsslaget “taxon” eller “kategori”. | ||
Laboratorieanalysresultat | ||||||
| typ | Cx—HPV-DNA | NPU |
| ||
3. | värde | 10828004 | positiv | Snomed CT | Resultaten kan koderas med en Snomed CT kod eller fritext. | |
4. | kommentar |
| Typ 35, 40, 51, 52, 53, 59, 68 |
|
| Kommentaren anges med fritext. |
3. Informationsmodell för typning/sekvensering (HPV)
Informationsmodell för typning/sekvensering (HPV)
4. XML-kod för exemplet typning/sekvensering (HPV)
<s:Envelope xmlns:s="http://schemas.xmlsoap.org/soap/envelope/">
<s:Body xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xmlns:xsd="http://www.w3.org/2001/XMLSchema">
<GetLaboratoryOrderOutcomeResponse xmlns="urn:riv:clinicalprocess:healthcond:actoutcome:GetLaboratoryOrderOutcomeResponder:4">
<laboratoryOrderOutcome>
<header xmlns='urn:riv:clinicalprocess:healthcond:actoutcome:4'>
<accessControlHeader>
<accountableCareGiver>
<root>1.2.752.129.2.1.4.1</root>
<extension>TSTNMT2321000156-1002</extension>
</accountableCareGiver>
<accountableCareUnit>
<root>1.2.752.129.2.1.4.1</root>
<extension>TSTNMT2321000156-1003</extension>
</accountableCareUnit>
<lockTime>20180107105400</lockTime>
<blockComparisonTime>20180107105400</blockComparisonTime>
<approvedForPatient>true</approvedForPatient>
</accessControlHeader>
<sourceSystemId>
<root>1.2.752.129.2.1.4.1</root>
<extension>LOAD-MOCKS</extension>
</sourceSystemId>
<record>
<id>
<root>LOAD-MOCKS</root>
<extension>LOAD-MOCKS-GMH-DEMO-24</extension>
</id>
<timestamp>20180107105400</timestamp>
</record>
<author>
<id>
<root>1.2.752.129.2.1.4.1</root>
<extension>TESTNMT00123-OJFG</extension>
</id>
<name>PC Jersild</name>
<timestamp>20180107105400</timestamp>
<byRole>
<originalText>Läkare</originalText>
</byRole>
</author>
<signature>
<id>
<root>1.2.752.129.2.1.4.1</root>
<extension>SE162321000024-0004</extension>
</id>
<name>Marie Carlsson</name>
<timestamp>20180108105400</timestamp>
<byRole>
<originalText>Läkare</originalText>
</byRole>
</signature>
</header>
<body xmlns='urn:riv:clinicalprocess:healthcond:actoutcome:4'>
<identifier>
<root>LOAD-MOCKS</root>
<extension>LOAD-MOCKS-GMH-DEMO-24</extension>
</identifier>
<laboratoryIdentifier>
<root>LAB-IDENTIFIER</root>
<extension>LAB-IDENTIFIER-24</extension>
</laboratoryIdentifier>
<type>
<code>final</code>
<codeSystem>2.16.840.1.113883.4.642.3.235</codeSystem>
<displayName>Slutsvar</displayName>
</type>
<referral>
<identifier>
<root>LOAD-MOCKS</root>
<extension>RID-24</extension>
</identifier>
<timestamp>20180107105400</timestamp>
<version>1</version>
<question>HPV?</question>
<requester>
<id>
<root>1.2.752.129.2.1.4.1</root>
<extension>TESTNMT00123-OJFG</extension>
</id>
<name>Maria Gustafsson</name>
<byRole>
<originalText>Läkare</originalText>
</byRole>
<orgUnit>
<id>
<root>1.2.752.129.2.1.4.1</root>
<extension>TSTNMT2321000156-1003</extension>
</id>
<name>Infektionsavdelning, Uppsala</name>
</orgUnit>
</requester>
</referral>
<groupOfAnalyses>
<analysis>
<identifier>
<root>LOAD-MOCKS</root>
<extension>LOAD-MOCKS-GMH-DEMO-24</extension>
</identifier>
<timestamp>20180107175400</timestamp>
<code>
<code>NPU14485</code>
<codeSystem>1.2.752.108.1</codeSystem>
<codeSystemName>NPU</codeSystemName>
<displayName>Cx—HPV-DNA</displayName>
</code>
<status>
<code>398166005</code>
<codeSystem>1.2.752.116.2.1.1</codeSystem>
<codeSystemName>Snomed CT</codeSystemName>
<displayName>utförd</displayName>
</status>
<accredited>false</accredited>
<specimen>
<material>
<code>258451005</code>
<codeSystem>1.2.752.116.2.1.1</codeSystem>
<displayName>cervixsekret</displayName>
</material>
<timestamp>20180107105400</timestamp>
</specimen>
<result>
<type>
<code>NPU14485</code>
<codeSystem>1.2.752.108.1</codeSystem>
<codeSystemName>NPU</codeSystemName>
<displayName>Cx—HPV-DNA</displayName>
</type>
<value>
<cv>
<code>10828004</code>
<codeSystem>1.2.752.116.2.1.1</codeSystem>
<codeSystemName>Snomed CT</codeSystemName>
<displayName>positiv</displayName>
</cv>
</value>
<comment>Typ 35,40,51,52,53,59,68</comment>
</result>
</analysis>
</groupOfAnalyses>
<recipientUnit>
<name>Vårdcentral kaffekoppen</name>
</recipientUnit>
<contactInformation>
<text>Laboratoriemedicin Uppsala 018-123 456 789</text>
</contactInformation>
</body>
</laboratoryOrderOutcome>
</GetLaboratoryOrderOutcomeResponse>
</s:Body>
</s:Envelope>