1.3.9 Mykobakterier, mikroskopi, odling och resistensbestämning

Detta är ett exempel på ett laboratoriesvar för mikroskopisk påvisning av mykobakterier i ett sputumprov, följt av odling och en resistensbestämning. Den mikroskopiska analysen svaras ut ordinalt (negativ). En odling utförs också där resultatet svaras ut nominalt (Mycobacterium chelonae) med efterföljande resistensbestämning (SIR).

1. Visning av förekomst av mykobakterier, mikroskopi, odling och tillhörande resistensbestämning i NPÖ och 1177 journal

2. Tabell med kodade värden som används i exemplet och tillhörande kommentarer

#	Namn	Kod	Benämning	Kodverk	Urval	Kommentar
Prov
1.	material	119334006	sputum	Snomed CT	urval provtyp laboratoriemedicin	Provmaterialet kan även anges som fritext.
Laboratorieanalys (mikroskopi och odling)
2.	kod	NPU12785	Sputum—Mykobakterie	NPU	urval analyskoder laboratoriemedicin	För analyser som påvisar bakterier och svaras ut ordinalt så väljs NPU-koder med egenskapsslaget “arbiträr koncentration”
2.	kod	NPU09278	Sputum—Mykobakterieodling	NPU	urval analyskoder laboratoriemedicin	För odlingsanalyser som svaras ut med fynd av bakterier så väljs NPU-koder med egenskapsslaget “taxon”.
3.	metod	117259009	mikroskopi	Snomed CT	urval analysmetod laboratoriemedicin	Det är frivilligt att ange metod.
3.	metod	252398009	allmän odling	Snomed CT	urval analysmetod laboratoriemedicin	Det är frivilligt att ange metod.
Laboratorieanalys (resistensbestämning)
4.	kod	NPU14407	Imipenem	NPU	urval analyskoder laboratoriemedicin	Separata NPU-koder används för respektive antibiotika. Notera att olika koder också används för resultat som svaras ut som SIR eller MIC-värden (mg/L).
		NPU06004	Azitromycin
		NPU06023	Klaritromycin
		NPU06026	Doxycyklin
		NPU29671	Tigecyklin
Laboratorieanalysresultat (mikroskopi och odling)
	typ	NPU12785	Sputum—Mykobakterie	NPU	urval analyskoder laboratoriemedicin
	typ	NPU09278	Sputum—Mykobakterieodling	NPU	urval analyskoder laboratoriemedicin
5.	värde	260385009	negativ	Snomed CT	urval fynd övrigt laboratoriemedicin
5.	värde	243377008	Mycobacterium chelonae	Snomed CT	urval fynd mikroorganism laboratoriemedicin
Laboratorieanalysresultat (resistensbestämning)
	typ	NPU14407	Imipenem	NPU	urval analyskoder laboratoriemedicin
		NPU06004	Azitromycin
		NPU06023	Klaritromycin
		NPU06026	Doxycyklin
		NPU29671	Tigecyklin
6.	värde	131196009	S	Snomed CT	urval fynd resistens laboratoriemedicin	Ordinala resultat koderas med en Snomed CT kod.
		264841006	I
		30714006	R