1. Klinisk mikrobiologi


Introduktion

Här visas en översikt av de mikrobiologiska analyser som exemplifieras i tillämpningsanvisningen och vilket visningsformat som används. Klicka på exemplen i tabellen för att se hur de mikrobiologiska svaren koderas och visas i nationell patientöversikt (NPÖ) och 1177 journal. I exemplet finns också tips för att hitta rätt koder för liknande analyser och tillhörande information.

Tabellen är uppdelad på de huvudsakliga tekniker som används för att påvisa, kvantifiera och karaktärisera mikrobiologiska organismer.


Molekylärdiagnostik

Utförs för att identifiera mikroorganismer baserat på deras genetiska innehåll (DNA och RNA). Dessa analyser detekterar antingen specifika mikroorganismer, eller är paneler av test som har möjlighet att identifiera flera olika mikroorganismer samtidigt. Det finns också analyser som identifierar subtyper av mikroorganismer. Resultaten från dessa olika analyser svaras oftast ut:
- ordinalt (ex. påvisad/ej påvisad eller positiv/negativ)
- kvantitativt (ex. kE/L, kIE/L eller IU/ml)
- nominalt (ex. vilken bakterie eller vilket virus som identifierats)


Serologisk diagnostik

Utförs för att påvisa antikroppar mot mikrobiologiska agens, vilket kan indikera en aktuell infektion eller immunitet. Direktpåvisning av antigen är också en vanlig serologisk analys. Resultaten från dessa analyser svars oftast ut:
- ordinalt (ex. påvisad/ej påvisad eller positiv/negativ)
- kvantitativt (ex. kE/L, kIE/L eller IU/ml)

Samtest

Utförs för att serologiskt påvisa att antikroppar har producerats intratekalt genom att analysera prov från cerebrospinalvätska och blod från ett och samma provtagningstillfälle. Resultaten från dessa analyser svaras oftast ut:
-kvantitativt (ex. titer-värde)


Odlingsdiagnostik och resistensbestämningar

Utförs för att identifiera och klassificera mikrobiologiska organismer, samt undersöka vilka antimikrobiella läkemedel som är effektiva för att hindra tillväxt och spridning. Resultaten för dessa analyser svaras oftast ut:
- nominalt (ex. vilken mikroorganism som identifierats)
- ordinalt (ex. påvisande av mikroorganism)
- kvantitativt (ex. hur mycket växer mikroorganismen)

Resistensbestämningar för de identifierade mikroorganismerna med olika substanser görs konsekutivt svaras ut ordinalt (S=känslig, I=känslig vid ökad exponering, R=resistent) eller kvantitativt (MIC-värde, mg/L).


Tabell med exempel på mikrobiologiska analyser

Mikrobiologiska analyser

Mikrobiologiska analyser

1.1 Molekylärdiagnostik

#

Typ av analys

Länk till exempel

Typ av resultat

Visningsformat

1.1.1

Virus-påvisning

Luftvägsblock

ordinalt

A

 

1.1.2

Virus-kvantifiering

Adenovirus och Hepatit C

kvantitativt

1.1.3

Typning/
sekvensering

Humant papillomvirus (HPV)

ordinalt/
nominalt

1.2. Serologisk diagnostik

 

 

#

Typ av analys

Länk till exempel

Typ av resultat

Visningsformat

1.2.1

Virusserologi

HIV

ordinalt

 

A

1.2.2

Hepatit B

1.2.3

CMV, EBV, Mässlingsvirus

kvantitativt
ordinalt

1.2.4

Infektionsserologi

VZV, HSV, Borrelia

ordinalt

1.2.5

Samtest

Intratekala antikroppar

kvantitativt

A eller C

1.3. Odlingsdiagnostik och resistensbestämningar

 

 

#

Typ av analys

Länk till exempel

Typ av resultat

Visningsformat

1.3.1

Sårodling

Sårodling med resistensbestämning - 2 fynd (SIR & MIC)

nominalt
ordinalt

B

1.3.2

Sårodling med resistensbestämning
(SIR & MIC)

nominalt
ordinalt
kvantitativt

1.3.3

Urinodling

Urinodling: kvantitativ och resistensbestämning (SIR)

nominalt
ordinalt
kvantitativt

1.3.4

Urinodling utan resistensbestämning

nominalt

A

1.3.5

Blododling

Blododling med resistensbestämning (SIR & MIC)

nominalt
ordinalt

B

1.3.6

Blododling utan resistensbestämning (preliminärt svar)

kvantitativt
nominalt

A

1.3.7

MRSA

MRSA-screening, odling och resistensbestämning (SIR)

ordinalt
nominalt

B

1.3.8

VRE

VRE-screening, odling och resistensbestämning (SIR & MIC)

ordinalt
nominalt

1.3.9

Mykobakterier

Mikroskopi, odling och resistensbestämning (SIR)

ordinalt
nominalt